Tecnologia de sequenciamento de DNA, a PacBio Sequel II, do SENAI CETIQT, é padrão-ouro em pesquisa genômica na atualidade


Equipamento do SENAI CETIQT é referência. “Diversos pesquisadores do Brasil fazem parte desta missão e estão trabalhando arduamente para que possamos conhecer melhor a biodiversidade brasileira através do sequenciamento de seus genomas e estão buscando a plataforma PacBio Sequel II para atingir este fim”, comenta Carlos Xavier, consultor pesquisador da área de Biotecnologia do SENAI CETIQT

A maior parte da biodiversidade do planeta é composta por organismos com organização genômica complexa. Sequenciar esses genomas é vital, uma vez que o conhecimento sobre a biologia dos seres vivos abre espaço para inúmeros estudos, como: conservação de espécies ameaçadas de extinção, identificação de fármacos e outros compostos naturais e, até mesmo, melhor entendimento sobre doenças do ser humano e sobre como tratá-las. Nesse contexto de importância, atua a PacBio, uma das principais fabricantes atuais de sequenciadores, que tem se diferenciado por conseguir alcançar, em seus equipamentos mais recentes, um equilíbrio entre a geração de sequências longas de DNA e a qualidade do sequenciamento, apresentando baixíssimas taxas de erro.

“O sequenciamento de DNA, através do PacBio Sequel II, é um divisor de águas em diferentes tipos de linhas de pesquisas conduzidas nas universidades, principalmente naquelas que lidam com organismos complexos (como animais e plantas), pois estes possuem genomas contendo geralmente múltiplos conjuntos de cromossomos, sequências de DNA repetitivos (como elementos transponíveis e telômeros), dentre outras particularidades que tornam o seu sequenciamento uma tarefa bastante árdua com as tecnologias mais antigas”, explicou Carlos Xavier, Consultor Pesquisador da área de Biotecnologia do SENAI CETIQT.

Com o fito de solucionar esse desafio, pesquisadores do mundo todo têm se organizado em consórcios internacionais voltados para o sequenciamento de milhares de espécies de seres vivos. O Vertebrate Genomes Project é um exemplodo esforço científico da área. Focado no mapeamento genômico de todos os vertebrados do mundo e a preservação de dados em verdadeiras arcas genômicas, o projeto é resultado de uma cooperação internacional dedicada ao desenvolvimento da área. Consórcios como esse definem o sequenciamento de terceira geração – como é o caso da PacBio – como o padrão-ouro necessário à criação dos genomas de alta qualidade, que serão fundamentais para a preservação do conhecimento sobre a organização da biodiversidade mundial.

“Diversos pesquisadores do Brasil fazem parte desta missão e estão trabalhando arduamente para que possamos conhecer melhor a biodiversidade brasileira através do sequenciamento de seus genomas e estão buscando a plataforma PacBio Sequel II para atingir este fim”, comenta Carlos.

Além da vantagem ecológica, a utilização da plataforma PacBio também impacta o sequenciamento de alta qualidade de outro tipo de organismo específico: o ser humano. Os equipamentos da PacBio são fundamentais para o fechamento dos fragmentos remanescentes no genoma humano, tarefa desempenhada pelo consórcio Telomere 2 Telomere e amplamente divulgada na mídia em 2022.

“Com os genomas produzidos pela tecnologia de fragmentos longos, é possível estudar variantes estruturais associadas a diferentes tipos de doenças e síndromes que antes não poderiam ser tão bem estudadas, de forma que agora os pesquisadores têm todo um novo universo de investigações à sua frente na busca por novas oportunidades na medicina – principalmente naquela chamada ‘de precisão’, ou seja, orientada especificamente ao perfil genético de cada paciente”, completa o pesquisador Carlos.

Por ter equipamentos que cobrem as diferentes gerações de tecnologias de sequenciamento, o Instituto SENAI de Inovação em Biossintéticos e Fibras do SENAI CETIQT (ISI) oferece aos professores e pesquisadores vantagens para pesquisas de sequenciamento genômico, além da flexibilidade de oferecer serviços que se acomodem às demandas científicas.